Desarrollo de un enfoque de tipificación de secuencia MultiLocus- anidado para una identificación altamente sensible y específica de subespecies de Xylella fastidiosa directamente de muestras de plantas
Para mejorar la sensibilidad de la identificación de X. fastidiosa, desarrollamos un ensayo de tipificación de secuencia MultiLocus (MLST) anidado directo en ADN extraído de plantas. Este método se realizó con base en un esquema ampliamente utilizado dirigido a siete loci del gen (HKG) (cysG, gltT, holC, leuA, malF, nuoL, petC). Las muestras analizadas incluyeron 49 especies de plantas y dos especies de insectos (Philaenus spumarius, Neophilaenus campestris) que se recolectaron en 2017-2019. Con el enfoque anidado, se amplificó un número significativamente mayor de muestras. El umbral mejoró entre 100 y 1000 veces en comparación con la PCR convencional.
- Más información en: mdpi.com
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