Primer informe de infección de remolacha por el virus Beet soil-borne virus trasmitido por el suelo

Investigadores recolectaron una muestra de remolacha (Beta vulgaris subsp. vulgaris) sintomática de un pequeño campo en Rheinland-Pfalz, Alemania, donde varias plantas mostraron síntomas similares a Beet necrotic yellow vein virus (necrosis, reducción de tamaño y en particular proliferación de la raíz). Sin embargo, a través de microscopía electrónica de inmunoabsorción (ISEM), no se logró la identificación del agente causal.
En contraste, mediante la preparación de una biblioteca de ARNm,la secuenciación NextSeq 550 y el análisis de datos; los contigs generados fueron comparados con la base de datos de referencia del virus local empleando tBlastx, 21 contigs mostraron similitud con Beet soil-borne virus (BSBV) y Beet cryptic virus-2 (BCV-2). Para confirmar la infección, se empleó la técnica RT-PCR,demostrando que el agente causal de las muestras sintomáticas es el BSBV.
Por otra parte, los genomas casi completos de BSBV y BCV-2 se ensamblaron mediante un mapeo, utilizando secuencias de referencia del Genbank (BSBV: NC_003518-NC_003520 y BCV-2:NC_038845-NC_038847). El análisis de secuencia reveló que el aislado BSBV comparte una identidad de nucleótidos del 97.3-98.5% con el genoma de referencia (aislado alemán NC_003518-NC_003520).El aislado BCV-2 comparte 98.7-99.7% de identidad de nucleótidos con el genoma de referencia (aislado húngaro NC_038845-NC_038847).
Este trabajo proporciona la primera sugerencia de que BSBV infecta naturalmente a la remolacha. Esta identificación expone el límite de los métodos de diagnóstico como ISEM y también destaca la fuerza de la secuenciación de alto rendimiento (NextSeq 550) para diagnosticar virus vegetales de forma rápida y precisa.
- New Disease Reports
- Más información en: ndrs.org.uk
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