Vigilancia de Citrus tristeza virus en Citrus paradisi Cv. "Marsh" en Sudáfrica
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Sudáfrica se encuentra entre los principales productores de toronja en el mundo, sin embargo, los árboles con protección cruzada a menudo muestran un surco severo del tallo, independientemente del portainjerto. Anteriormente, las fuentes de protección cruzada se evaluaban empíricamente, mediante inoculaciones de injerto en hospedadores indicadores. Investigaciones recientes han demostrado que la protección cruzada, posiblemente mediada por la exclusión de superinfección, es específica de la cepa. Esto, junto con las afinidades variables que muestran los cultivares para diferentes cepas de CTV, ha demostrado la necesidad de determinar qué cepas de CTV están asociadas con cultivares comerciales específicos. En este estudio, se tomaron muestras de 36 arboles de Citrus paradisi cv "Marsh". Las poblaciones de CTV de estas muestras se analizaron mediante la amplificación del gen p33 y la posterior secuenciación directa de Sanger. Se seleccionó un subconjunto de 12 de estos amplicones para la secuenciación profunda de Illumina MiSeq. Los datos resultantes mostraron alta diversidad intra e inter-huerto de CTV, con poblaciones que muestran composiciones de genotipo similares a las encontradas en estudios recientes en el cultivar "Star Ruby". Las poblaciones se componían de un componente claramente dominante, en la mayoría de los casos secuencias RB o Kpg3 / SP / T3, con al menos dos tipos de secuencias menores. Se encontró que las secuencias AT-1 y similares a VT eran dominantes en solo cuatro y una de las poblaciones analizadas, respectivamente.
- Investigaciones
- European Journal of Plant Pathology
- Más información en: link.springer.com
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