Comparación de cebadores para la detección de Phytophthora a partir de muestras ambientales
Usaron la plataforma de secuenciación de Illumina para comparar 13 combinaciones de cebadores en comunidades simuladas y muestras ambientales. Los cebadores diseñados para oomicetos subestimaron la comunidad de Phytophthora en comparación con los cebadores específicos de Phytophthora. Se recomienda utilizar réplicas técnicas, combinaciones de cebadores, controles internos y un enfoque filogenético para asignar una identidad de especie a OTU o ASV.
- Más información en: mdpi.com
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